1966年5月16日，中共中央下发《中国共产党中央委员会通知》（简称“五一六通知”），标志“文化大革命”运动开始。是年秋，五一、西岑、南灶3个大队成立“文化大革命”领导小组，设主任1人，委员3～5人，同时成立红卫兵组织。五一、西岑、南灶3个大队开展破“四旧”（ 旧思想、旧文化、旧风俗、旧习惯）、立“四新”（新思想、新文化、新风俗、新习惯）运动，对地主、富农、反革命分子、坏分子（简称四类分子）进行抄家，见到一些旧的字画、书籍、古式家具、金银首饰等给予销毁或抄走，对稍有不满的地主、富农分子在大队部召开群众大会进行批斗、游村。10月，南灶大队第五生产队沈福根作为莘新农业中学的红卫兵代表，赴北京在天安门广场受到毛泽东等中央领导的检阅。12月，五一、西岑、南灶3个大队开展对走资本主义道路当权派的斗争，大字报满天飞，对大队干部和部分生产队队长作为走资本主义道路当权派进行批斗。1968年3月，南灶大队杭金林任莘塔公社革命委员会副主任，南灶大队第三生产队王稼祥任莘塔公社革命委员会委员。4月，五一、西岑、南灶3个大队开展清理阶级队伍运动（简称“清队”）。6月12日，五一大队2人受芦墟“现行反革命集团” 案波及，被隔离审査，其中1人关押审查138天。1969年2月10～16日，五一、西岑、南灶3个大队成立革命委员会（简称“革委会”），设主任1人，委员5～7人。五一大队革委会主任张沛雨，西岑大队革委会主任唐留金，南灶大队革委会主任杭和弟。1973年春，对“文化大革命”中查抄物资进行清理、返还，损坏、遗失的物品折价赔偿。是年秋，查抄物资退赔工作结束。

1976年10月，党中央一举粉碎“四人帮” 反革命集团， 文化大革命结束。1978年7月19日，莘塔公社落实政策办公室对在“清队”中遭受迫害致死的五一大队第一生产队王银褔、第二生产队王仁堂、第十生产队王瑞珠平反昭雪。1979年1月15日，莘塔公社落实政策办公室对在“文化大革命”期间蒙受不白之冤的五一大队7人、西岑大队23人、南灶大队11人恢复名誉，并视遭受冤屈的程度，给予经济补偿。